از قرون وسطا به بعد، علوم و نظریه های جدیدی مبنا گذاری شد، درحالی که در مدارس و داشنگاه های ما به ما آموزند که این نظریه ها، علمی بودند و از آنجایی که کلیسا مخالف علم بود، اینان در خطر کلیسا بودند، درواقع اصلا مسئله چنین نیست. علوم فیزیک و طب از بسیاری قبل وجود داشت، درواقع خود کلیسا نیز کاملا علمی بوده و معتقد به نظریه های مختلف، ولی بحثی که در علیه کلیسا وجود دارد، یکسری نظریه علمی نیست، درواقع مجموعه نظریه هایی فلسفی است.